MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 43529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016790	CTG	2	6	83	88	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256019
2	NC_016790	AAC	2	6	89	94	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256019
3	NC_016790	CGT	2	6	223	228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256019
4	NC_016790	CAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256019
5	NC_016790	ACT	2	6	347	352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256019
6	NC_016790	ACA	2	6	404	409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256019
7	NC_016790	CGA	2	6	420	425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256019
8	NC_016790	TCG	3	9	516	524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256019
9	NC_016790	AGC	3	9	533	541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256019
10	NC_016790	GAA	2	6	559	564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256019
11	NC_016790	CGC	2	6	580	585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256019
12	NC_016790	GA	3	6	588	593	50 %	0 %	50 %	0 %	376256019
13	NC_016790	CAA	2	6	672	677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256019
14	NC_016790	CGG	2	6	689	694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256019
15	NC_016790	GC	4	8	718	725	0 %	0 %	50 %	50 %	376256019
16	NC_016790	TTC	2	6	837	842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256019
17	NC_016790	TGA	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256019
18	NC_016790	CGA	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256019
19	NC_016790	TTC	2	6	982	987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256019
20	NC_016790	CA	3	6	988	993	50 %	0 %	0 %	50 %	376256019
21	NC_016790	GCA	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256019
22	NC_016790	CCGC	2	8	1041	1048	0 %	0 %	25 %	75 %	376256019
23	NC_016790	CCA	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256019
24	NC_016790	CGG	2	6	1166	1171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256019
25	NC_016790	ATG	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256019
26	NC_016790	GCAG	2	8	1341	1348	25 %	0 %	50 %	25 %	376256019
27	NC_016790	CGG	2	6	1361	1366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256019
28	NC_016790	CTG	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256019
29	NC_016790	TGG	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256019
30	NC_016790	ACG	2	6	1540	1545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256019
31	NC_016790	ACG	2	6	1601	1606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256019
32	NC_016790	CAG	2	6	1612	1617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256019
33	NC_016790	GCA	2	6	1623	1628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256019
34	NC_016790	GAC	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256020
35	NC_016790	CCA	2	6	2371	2376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256020
36	NC_016790	GC	3	6	2396	2401	0 %	0 %	50 %	50 %	376256020
37	NC_016790	TCA	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256020
38	NC_016790	CCG	2	6	2413	2418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256020
39	NC_016790	GCCA	2	8	2491	2498	25 %	0 %	25 %	50 %	376256020
40	NC_016790	CAT	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256020
41	NC_016790	TCG	2	6	2572	2577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256020
42	NC_016790	TTC	2	6	2606	2611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256020
43	NC_016790	CGA	2	6	2639	2644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256020
44	NC_016790	TGC	2	6	2713	2718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256020
45	NC_016790	TGC	2	6	2723	2728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256020
46	NC_016790	ACG	2	6	2834	2839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256020
47	NC_016790	GCT	2	6	2879	2884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256020
48	NC_016790	GAA	2	6	2894	2899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256020
49	NC_016790	ACC	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256020
50	NC_016790	GCT	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256020
51	NC_016790	CCG	2	6	3128	3133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256020
52	NC_016790	CGA	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256020
53	NC_016790	TC	3	6	3197	3202	0 %	50 %	0 %	50 %	376256020
54	NC_016790	TGG	2	6	3206	3211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256020
55	NC_016790	CCGTG	2	10	3238	3247	0 %	20 %	40 %	40 %	376256020
56	NC_016790	AAGC	2	8	3400	3407	50 %	0 %	25 %	25 %	376256020
57	NC_016790	ACCT	2	8	3444	3451	25 %	25 %	0 %	50 %	376256020
58	NC_016790	TTG	2	6	3601	3606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256021
59	NC_016790	TTG	2	6	3634	3639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256021
60	NC_016790	GT	3	6	3676	3681	0 %	50 %	50 %	0 %	376256021
61	NC_016790	AAAGA	2	10	3706	3715	80 %	0 %	20 %	0 %	376256021
62	NC_016790	GT	3	6	3724	3729	0 %	50 %	50 %	0 %	376256021
63	NC_016790	CTG	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256021
64	NC_016790	GCT	2	6	3839	3844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256021
65	NC_016790	GTT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256021
66	NC_016790	TGC	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256021
67	NC_016790	CAG	2	6	4018	4023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256021
68	NC_016790	TGC	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256021
69	NC_016790	CGT	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256021
70	NC_016790	TGA	2	6	4052	4057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256021
71	NC_016790	TG	3	6	4079	4084	0 %	50 %	50 %	0 %	376256021
72	NC_016790	TGG	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256021
73	NC_016790	TCAT	2	8	4117	4124	25 %	50 %	0 %	25 %	376256021
74	NC_016790	ATG	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256021
75	NC_016790	TGT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256021
76	NC_016790	GAA	2	6	4263	4268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256021
77	NC_016790	TGCT	2	8	4282	4289	0 %	50 %	25 %	25 %	376256021
78	NC_016790	TGG	2	6	4336	4341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256021
79	NC_016790	TGA	2	6	4352	4357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256021
80	NC_016790	TGC	2	6	4456	4461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256021
81	NC_016790	ATG	2	6	4465	4470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256021
82	NC_016790	GAT	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256021
83	NC_016790	CGT	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256021
84	NC_016790	TCA	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256021
85	NC_016790	GGTG	2	8	4583	4590	0 %	25 %	75 %	0 %	376256021
86	NC_016790	CGG	2	6	4618	4623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256021
87	NC_016790	CGC	2	6	4682	4687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256021
88	NC_016790	ATG	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256021
89	NC_016790	CTG	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256022
90	NC_016790	AGG	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256022
91	NC_016790	A	6	6	4756	4761	100 %	0 %	0 %	0 %	376256022
92	NC_016790	ACG	2	6	4826	4831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256022
93	NC_016790	AAC	2	6	4850	4855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256022
94	NC_016790	GTC	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256022
95	NC_016790	GGC	3	9	4886	4894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256022
96	NC_016790	GAT	2	6	4996	5001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256022
97	NC_016790	TGG	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256022
98	NC_016790	TGC	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256022
99	NC_016790	ATG	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256022
100	NC_016790	TAT	2	6	5115	5120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256022
101	NC_016790	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256022
102	NC_016790	GGC	2	6	5198	5203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256022
103	NC_016790	CAC	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256023
104	NC_016790	CGA	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256023
105	NC_016790	CGG	2	6	5571	5576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256023
106	NC_016790	GGT	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256023
107	NC_016790	CGT	2	6	5733	5738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256023
108	NC_016790	ACC	2	6	5860	5865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256023
109	NC_016790	ACC	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256023
110	NC_016790	CTT	2	6	5949	5954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256023
111	NC_016790	GAA	2	6	6028	6033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256023
112	NC_016790	TCGATG	2	12	6068	6079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	376256023
113	NC_016790	CTG	2	6	6101	6106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256023
114	NC_016790	AAG	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256023
115	NC_016790	AAG	2	6	6127	6132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256023
116	NC_016790	TCT	2	6	6137	6142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256023
117	NC_016790	CCACC	2	10	6198	6207	20 %	0 %	0 %	80 %	376256023
118	NC_016790	ATC	2	6	6208	6213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256023
119	NC_016790	AAC	2	6	6265	6270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256023
120	NC_016790	TGA	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256023
121	NC_016790	AAGGAA	2	12	6400	6411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256023
122	NC_016790	CGA	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256023
123	NC_016790	CCG	2	6	6449	6454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256023
124	NC_016790	AGACCA	2	12	6494	6505	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	376256023
125	NC_016790	ATC	2	6	6601	6606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256023
126	NC_016790	GC	3	6	6631	6636	0 %	0 %	50 %	50 %	376256023
127	NC_016790	GGC	2	6	6639	6644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256023
128	NC_016790	GC	3	6	6652	6657	0 %	0 %	50 %	50 %	376256023
129	NC_016790	CGT	2	6	6667	6672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256023
130	NC_016790	CGG	2	6	6690	6695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256023
131	NC_016790	GGT	2	6	6775	6780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256023
132	NC_016790	TTC	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256023
133	NC_016790	ATC	2	6	6898	6903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256023
134	NC_016790	ATG	2	6	6926	6931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256023
135	NC_016790	TGC	2	6	7013	7018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256023
136	NC_016790	GAA	2	6	7054	7059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256023
137	NC_016790	CCA	2	6	7081	7086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256023
138	NC_016790	CTTG	2	8	7152	7159	0 %	50 %	25 %	25 %	376256023
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140	NC_016790	GAC	2	6	7195	7200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256023
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142	NC_016790	TCT	2	6	7325	7330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256023
143	NC_016790	GAC	2	6	7345	7350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256023
144	NC_016790	TTA	2	6	7370	7375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256023
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152	NC_016790	ATC	2	6	8227	8232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256025
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154	NC_016790	GC	3	6	8385	8390	0 %	0 %	50 %	50 %	376256025
155	NC_016790	GGCG	2	8	8491	8498	0 %	0 %	75 %	25 %	376256026
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157	NC_016790	GCT	2	6	8532	8537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256026
158	NC_016790	GCG	2	6	8538	8543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256026
159	NC_016790	TGG	2	6	8554	8559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256026
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162	NC_016790	GC	3	6	8605	8610	0 %	0 %	50 %	50 %	376256026
163	NC_016790	CTG	2	6	8620	8625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256026
164	NC_016790	CGA	2	6	8762	8767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256027
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166	NC_016790	GGT	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256027
167	NC_016790	GAG	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256027
168	NC_016790	TCG	2	6	8860	8865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256027
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172	NC_016790	ACG	2	6	9220	9225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256027
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174	NC_016790	CTG	2	6	9270	9275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256027
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187	NC_016790	AAC	2	6	9735	9740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256027
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247	NC_016790	AG	3	6	12612	12617	50 %	0 %	50 %	0 %	376256029
248	NC_016790	CCGGTG	2	12	12667	12678	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	376256029
249	NC_016790	AG	3	6	12732	12737	50 %	0 %	50 %	0 %	376256029
250	NC_016790	CTT	2	6	12830	12835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256029
251	NC_016790	GAG	2	6	13023	13028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256030
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254	NC_016790	ATC	2	6	13123	13128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256030
255	NC_016790	CGA	2	6	13133	13138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256030
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257	NC_016790	CGG	2	6	13253	13258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256030
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259	NC_016790	GAA	2	6	13284	13289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256030
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386	NC_016790	TCA	2	6	20971	20976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256036
387	NC_016790	GCG	2	6	20980	20985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256036
388	NC_016790	AGA	2	6	21337	21342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256037
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392	NC_016790	CTC	2	6	21460	21465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256037
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499	NC_016790	GTG	2	6	25821	25826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256043
500	NC_016790	TGA	2	6	25837	25842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256043

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